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Nach verschiedenen Lehr- und Forschungstätigkeiten im In- und Ausland – 1998 ''Visiting-Scholar'' an der Mahatma Ghandi University (Kerala/Indien); 2001 ''Fulbright-Scholar'' an der ''St. John’s University'' (Minnesota, [[USA]]); 2002/03 Professor für Patrologie an der Philosophisch-Theologischen Hochschule Heiligenkreuz, Lehrtätigkeit an den Universitäten Graz und Salzburg, 2003-2005 ''Visiting Professor'' und ''Associate Director'' der ''Division of Religious and Theological Studies'' an der ''Boston University'' (Massachusetts, USA) – ist er seit 2005 Professor für Patristik und Kirchengeschichte in Salzburg.  

Nach verschiedenen Lehr- und Forschungstätigkeiten im In- und Ausland – 1998 ''Visiting-Scholar'' an der Mahatma Ghandi University (Kerala/Indien); 2001 ''Fulbright-Scholar'' an der ''St. John’s University'' (Minnesota, [[USA]]); 2002/03 Professor für Patrologie an der Philosophisch-Theologischen Hochschule Heiligenkreuz, Lehrtätigkeit an den Universitäten Graz und Salzburg, 2003-2005 ''Visiting Professor'' und ''Associate Director'' der ''Division of Religious and Theological Studies'' an der ''Boston University'' (Massachusetts, USA) – ist er seit 2005 Professor für Patristik und Kirchengeschichte in Salzburg.  

Seine Arbeitsschwerpunkte sind Orientalische Patristik und Historische Theologie, Geschichte und Gegenwart der Ostkirchen (Naher Osten, Europa, Nordamerika) sowie Katholische Kirche seit dem Zweiten Vatikanischen Konzil mit Fokus auf Dialog und Ökumene.

Seine Arbeitsschwerpunkte sind Orientalische Patristik und Historische Theologie, Geschichte und Gegenwart der Ostkirchen (Naher Osten, Europa, Nordamerika) sowie Katholische Kirche seit dem Zweiten Vatikanischen Konzil mit Fokus auf Dialog und Ökumene. Winkler ist spezialisiert auf Geschichte, Theologie und Kultur des syrischen, koptischen, armenischen, äthiopischen und indischen (malankara) Christentums. Er ist Leiter des ''ZECO - Zentrum zur Erforschung des Christlichen Ostens'' der Universität Salzburg, Konsultor im ''Päpstlichen Rat zur Förderung der Einheit der Christen'' und Vorsitzender der Sektion Salzburg der Stiftung Pro Oriente.

Im Jahr 2015 wurde Dietmar W. Winkler zum [[Rektoren und Dekane der Universität Salzburg|Dekan]] der Katholisch-Theologischen Fakultät der Paris-Lodron-Universität Salzburg gewählt.  

Im Jahr 2015 wurde Dietmar W. Winkler zum [[Rektoren und Dekane der Universität Salzburg|Dekan]] der Katholisch-Theologischen Fakultät der Paris-Lodron-Universität Salzburg gewählt.