Karner begann mit dem Fußball beim [[PSV Salzburg]], von wo er 2002 in die Nachwuchsabteilung des [[SV Austria Salzburg]] wechselte. 2005, nach der Übernahme durch [[Red Bull]], wurde er mit 15 Jahren Spieler bei den [[Red Bull Juniors]]. Im Sommer [[2007]] erlitt er eine Herzmuskelentzündung und fiel bis zur Herbstsaison aus. Im Frühjahr erfolgte jedoch der nächste Rückschlag, Karner brach sich den Mittelfußknochen und fiel erneut 2 Monate aus. In der Saison 2009/10 konnte er sich wieder in die Stammmannschaft zurückkämpfen. Füpr die Red Bull Juniors bestritt der Verteidiger 41 Spiele. In den Österreichischen Nachwuchsnationalmannschaften betstritt er insgesamt 24 Spiele. | Karner begann mit dem Fußball beim [[PSV Salzburg]], von wo er 2002 in die Nachwuchsabteilung des [[SV Austria Salzburg]] wechselte. 2005, nach der Übernahme durch [[Red Bull]], wurde er mit 15 Jahren Spieler bei den [[Red Bull Juniors]]. Im Sommer [[2007]] erlitt er eine Herzmuskelentzündung und fiel bis zur Herbstsaison aus. Im Frühjahr erfolgte jedoch der nächste Rückschlag, Karner brach sich den Mittelfußknochen und fiel erneut 2 Monate aus. In der Saison 2009/10 konnte er sich wieder in die Stammmannschaft zurückkämpfen. Füpr die Red Bull Juniors bestritt der Verteidiger 41 Spiele. In den Österreichischen Nachwuchsnationalmannschaften betstritt er insgesamt 24 Spiele. |